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Corazones y Códigos sigue la vida de Meliora Richter, una joven con poderes extraordinarios que fue criada en The Silenced, una organización secreta que experimenta con niños para convertirlos en armas. Después de escapar a los 13 años, Meliora se une a S.H.I.E.L.D., donde lucha contra amenazas globales. Aunque siempre ha sido fuerte y decidida, el amor nunca fue una opción para ella. Su vida ha estado marcada por la desconfianza, especialmente hacia las personas, y no estaba dispuesta a abrir su corazón.
Meliora comparte su vida con sus primas, Eliza y Nairo. Eliza, que escapó de "The Silenced" a los 13 años y luego fue capturada por Hydra, finalmente escapa a los 19 y ahora trabaja para la CIA. Nairo, con su habilidad para manipular mentes, trabaja para el FBI. Juntas, las tres han creado una familia unida, donde la complicidad y el apoyo mutuo son la base de su existencia. Aunque sus trabajos las mantienen ocupadas, siempre encuentran tiempo para estar juntas.
A pesar de su vida en S.H.I.E.L.D., Meliora sigue cerrada al amor, hasta que conoce a Natasha Romanoff. Al principio, la relación entre ambas es tensa y llena de desconfianza. Pero a medida que trabajan juntas en misiones, Meliora empieza a ver en Natasha algo más que una espía fría y calculadora. La conexión entre ellas va creciendo, y Meliora comienza a preguntarse si quizás ha estado evitando lo que su corazón realmente desea.
Mientras Meliora y Natasha enfrentan juntas peligros y desafíos, la joven vengadora se da cuenta de que el amor no es una debilidad, sino una fuerza que la puede ayudar a sanar. Así, Corazones y Códigos narra la transformación de Meliora, quien, después de haber vivido una vida de desconfianza, empieza a abrir su corazón a Natasha, enfrentando tanto sus miedos internos como las amenazas externas que acechan a los Vengadores.
