Cela fait 2 ans que la tuerie de danganronpa V3 c'est terminée,Suishi,Maki et Himiko ont pu reprendre une vie normale. Enfin presque,certaine personne qui s'auto proclamait les ultimes despair essayer de les faire sombrer dans le désespoir,jusqu'au jours ou ils vont trop loins et un nouveau cauchemars commence... une nouvelle tuerie entre survivants commence.