El Dr. Eggman finalmente ha perecido ante sus inumerables intentos por dominar Mobius, sin embargo aquello no quiere decir que Sonic debiera bajar la guardia. El villano ha puesto sus ojos en una dimensión paralela... un mundo totalmente opuesto y diferente a lo que es el mundo de aquellos animales antropomorfos, del cual ni siquiera saben de su existencia. Tú mundo, tal y como lo conoces, la Tierra. Sólo hay un solo ser capaz de impedir que los malvados planes del Dr. Robotnik se lleven a cabo, y para evitar que la Tierra como la conocemos caiga a la merced de aquél ruin y despreciable ser, Sonic y sus amigos deberán viajar para impedirlo. Sin embargo hay algo que mantendrá atado a Sonic en ese lugar, sin esperarlo.