Życie Naruto i Sasuke powoli zaczęło się układać i każdy starał się zapomnieć o starych ranach. Jednak wszystko się zmienia w jednym dniu, kiedy Naruto dowiaduje się, że jego ojciec żyje, a on sam jest na celowniku największej grupy przestępczej w Japonii. Naruto nie chce wybaczyć ojcu za to ile musiał wycierpieć, ale musi zignorować własne uczucia, by przetrwać.