Unos meses después de que X, Y, Shauna, Trevol y Tierno terminaran con el caos de Kalos, el mal vuelve con más fuerza a Kanto con el regreso del team rocket pero este no esta siendo controlado por Giovanni ni por Pryce, si no es una vieja enemiga de los Holders de Kanto que volvió desde Sinnoh con el objetivo de acabar con los Holders de esa región de una vez por todas, regresando al equipo rocket a la vida junto con algunos miembros anteriores de los equipo Rocket, Neo Rocket, Alto Mando, Aqua, Magma, Galaxia, Plasma y Flare. La amenaza se vuelve muy fuerte pero los Holders de Kanto no estarán solos en esto, sino los otros Holders irán a ayudar a detener las ambiciones de la villana o el villano principal. que pasara? quien es el villano? Ruby dejara de fingir su amnesia? Todas estas y más preguntas serán respondidas en esta historia