La série commence lors du premier jour d'internat de Meredith en chirurgie au Seattle Grace Hospital. Elle va devoir travailler pendant sept ans si elle veut réussir sa spécialité. Tout comme ses camarades internes de première année, Cristina Yang, Izzie Stevens, George O'Malley et Alex Karev. Elle était encore une étudiante il y a très peu de temps. Aujourd'hui, ils sont tous médecins, dans un métier où l'apprentissage peut mener les patients à la vie comme à la mort, au meilleur comme au pire. Ancienne chirurgienne renommée, la mère de Meredith (le Dr Ellis Grey) est atteinte de la maladie d'Alzheimer.
Ajoutez à cela la complexité et les hauts et les bas des vies personnelles des internes, leur quotidien n'est pas de tout repos... Mais très vite, ils prennent leurs marques, tissent de forts liens d'amitié et d'amour, s'entraident les uns les autres, tout en découvrant très vite les personnalités cachées des uns et des autres.
Grey's Anatomy se distingue aussi par le nombre impressionnant d'intrigues amoureuses développées entre les personnages eux-mêmes, comme : Meredith et Derek, Meredith et Finn, Derek et Addison, Addison et Mark, Cristina et Burke, Alex et Izzie, Izzie et George, George et Callie, le triangle amoureux Mark-Callie-Arizona, George et Lexie, Richard et Ellis Grey, Lexie et Mark, Alex et Josephine, Lexie et Jackson, Jackson et April, Richard et Catherine, le triangle amoureux Cristina-Owen-Teddy, Meredith et Nathan, Jackson et Stephanie, Owen et Amelia, etc.