Naruto est anéanti, tous ses amis qu'il croyait un minimum sympatiques se révèlent être des ninjas sans cœur qui haïssent désormais Naruto pour ce qu'il abrite dans son nombril.
Heureusement, Kyūbi, ou Kyū, comme il l'appelle, est là pour le soutenir dans cette dure épreuve pour le moins éprouvante.
Naruto va donc déserté le village durant trois ans dans le but de mettre le plus de distance possible entre ceux qu'il prenait comme des amis et lui même.
Mais malgré tous ses efforts, les liens persistent, entre Konoha et le Jinchūriki, et Naruto va revenir trois ans plus tard pour sauver de justesse Konoha de l'attaque d'Itachi et de Kisame, venus le capturer, en croyant qu'il était encore au village caché des feuilles.