Als Archäologin hatte Thefa in letzter Zeit nicht gerade Glück, weshalb ihre Ausgrabung unbedingt zum Erfolg werden muss. In dem Heiligtum, das sie schließlich entdeckt, kommt sie an einen antiken Gegenstand heran, der von einem geheimnisvollen Shiekah-Klan konstruiert wurde. Jener beherbergt mächtige Kräfte, die sie auf einen unverhofften Pfad durch die Gezeiten ihres Landes führen. Bei dem Versuch den Klan aufzuspüren, der das Relikt erschaffen hat, gerät sie in die Schusslinie einer Organisation, die sogar die Grenzen der Zeit überwindet, um Hyrule endgültig in die Herrschaft ihres dunklen Königs zu stürzen. Glücklicherweise trifft sie auf ihrer Reise den ein oder anderen Helden mit dem sie aus den Legenden bereits bestens vertraut ist.