Desde la última vez que una generación nació, la tecnología en el mundo humano ha avanzado tanto que ha provocado terribles fallos en el Digital World, tales como que el Dark Area se haya salido de control y esté empezando a engullir gran parte del mundo.
Con los datos que está obteniendo, se está creando un Digiegg oscuro, que se cree que puede ser el mismísimo ZeedMileniunmon, un Digimon que puede cambiar el curso de la historia y del destino de ambos mundos.
Para evitar el nacimiento de ZeedMileniunmon o de lo que sea que esté en ese Digiegg, una nueva generación nace, dispuesta a seguir los pasos de las siete anteriores y salvar ambos mundos de la destrucción.
Sin embargo, los humanos que ya habían ido, como científicos o militares, han vuelto contagiados de lo que parece una falla de datos, que a los humanos les afecta como una enfermedad que los va lentamente matando, llegando a enloquecerlos o incluso a asesinarse entre ellos.
¿Logrará la nueva generación detener al Dark Area antes de que todo el Digital World caiga en la más profunda oscuridad? ¿Sobrevivirán a la corrupción de sus propias vidas? ¿O por el contrario fallarán?