Naruto Uzumaki został spadkobiercą woli Nagato - jego zadaniem stało się przywrócenie pokoju w świecie targanym przez wojny i konflikty. Konan, jako jedna z niewielu żyjących członków Akatsuki, poprzysięga sobie bronić i wspierać chłopaka na jego drodze. Jej pomocniczym filarem stanie się Kurohiko - młoda dziewczyna, która wychowywała się w gronie poszukiwanych ninja rangi S. Nie było im jednak dane wiedzieć, że na ich wspólnej drodze pojawi się więcej przeszkód, niż się spodziewały.