Sakura Haruno é uma menina de 16 anos, filha caçula do líder do clã Haruno, Kizashi. Sakura sempre foi deixada de lado e maltratada por todos do seu clã, incluindo seus próprios pais. Depois de anos morando fora de Konoha para treinar jundo ao seu irmão mais velho Shyoi, decidiram voltar para sua cidade natal. Chegando na vila da folha, Sakura reencontra antigas amizades e conhece novas pessoas, incluindo um rapaz que lhe causa sentimentos diferentes com os quais ela nunca lidou. Mas como a vida não é feita apenas de flores, Sakura descobre um passado tenebroso e sua verdadeira linhagem, junto ela também descobre um poder oculto dentro de si, e a lenda de onde foi tirado o seu nome, para só então poder cumprir o seu destino.