Esta historia inicia 10 años después de los acontecimientos de fallout 4 con nuestro protagonista llamado Daniel que despierta sin saber nada, con sus recuerdos perdidos y ubicado en medio de una guerra entre La Hermandad Del Acero, minutmen y la República de Nueva California contra los Conquistadores un grupo que fue creado cinco años después de la caída del instituto esta facción es conformada por varios grupos Humanos y marginados como necrófagos, supermutantes, nocturnos, máquinas y synths. También 8 años después el científico Virgil y Harold lograrían liberar un compuesto químico en el aire que restauraría algunas zonas a su estado original como selvas, bosques, etc. Acompaña a Daniel en busca de respuestas acerca de su pasado y cual es el motivo de su presencia en este mundo apocalíptico, donde es matar o morir. Recuerda chico la guerra no cambia nunca