Durante una missione, il team Natsu si ritrova improvvisamente in un luogo sconosciuto abitato da umani, robot e creature alquanto bizzarre. Lì rincontreranno Shiki e il suo equipaggio, con il quale decideranno di trascorrere del tempo insieme. Sia Lucy che Rebecca hanno entrambe un ragazzo nel cuore, entrambe hanno un compagno dei cui sentimenti nei suoi confronti con il passare del tempo sono cresciuti irrefrenabilmente, e per il quale decideranno di formare un'alleanza per riuscire a conquistarlo. Riuscirà Lucy a trovare il coraggio di dichiararsi a Natsu? Riuscirà Rebecca a stare finalmente con il suo amato Shiki? Sarà davvero la Ninjamania di cui verranno improvvisamente affetti tutti i personaggi a salvare la situazione? In questa piccola vacanza sulla nave dell'Edens Zero, ognuno dovrà venire a patto con i propri sentimenti.