Hiver 1860, Thunder Mesa, Colorado : le mariage de la jeune Mélanie Ravenswood tourne au désastre lorsque ses parents meurent dans un tremblement de terre la veille de son union avec Jake Evans, avant que son père Henry ne revienne d'entre les morts pour s'opposer à la cérémonie.
Automne 1890, Chelsea Manor, Angleterre : Lady Ella Chelsea, enquêtrice de renom, reçoit la visite de Paul Frees, maire de Thunder Mesa. Celui-ci, fou de terreur, la supplie de mettre un terme aux actes terrifiants des fantômes qui hantent la ville. Ella est bien décidée à lever le voile sur la malédiction de l'Oiseau Tonnerre et sur les mystères qui entourent Phantom Manor.