30 juta tahun yang lalu, terjadi peristiwa yang sangat mencekam hingga membahayakan seluruh alam semesta. Para raksasa kegelapan mengincar Eternity Core yang gerbangnya hanya bisa dibuka oleh Yuzare, salah satu pendeta wanita sekaligus penjaga Eternity Core Suku Terran. Yuzare tiada karena dia mengorbankan dirinya untuk melindungi Bumi dari kejahatan dengan menyegel para raksasa kegelapan sebelum mencapai Etenity Core di masa lalu. 30 juta tahun kemudian, kekuatan Yuzare dan Eternity Core yang masih tersegel berada di tubuh keturunannya yang bernama Yuna Shizuma, anggota DSA (Detective Survival Adventure) yang merupakan anak tunggal dari Mitsukuni Shizuma dan Yurika Shizuma. Kekuatan penuh Yuzare yang masih tersegel hanya bisa digunakan oleh Yuna saja. Satu-satunya warisan kuno dari 30 juta tahun yang lalu adalah cincin Yuzare yang digunakan dalam menyegel kekuatan para raksasa kegelapan. Seribu tahun yang lalu adalah kematian seorang kesatria kegelapan bernama Dark Rider Sword yang tiada setelah peringatan kelahiran seorang anak cahaya dan kegelapan (Child of Light and Darkness) bernama Roxanne Tennyson atau Roxy. Seorang gadis keturunan Amerika-Korea yang merupakan teman dekat dan teman masa kecil Ultraman Zero. Kebangkitan kekuatan Dark Rider Sword membuat tubuhnya kehilangan kendali di masa lalu yang menyebabkannya memanggil beberapa monster yang mampu menghancurkan Bumi. Setelah sepuluh tahun, Roxy berhasil mengendalikan kekuatannya sebagai Dark Rider dan sebagai keturunan terakhir Annodite yang diturunkan dari neneknya, Verdona. Sementara itu, Ultraman Zero kembali setelah sepuluh tahun berpisah dengan teman masa kecilnya, Roxanne Tennyson atau Roxy, yang sangat ia sukai sejak kecil namun tidak pernah mengakui perasaannya. Zero dan Roxy terikat secara jiwa karena mereka berdua pada dasarnya adalah satu jiwa yang berada dalam tubuh yang berbeda. Apa yang terjadi selanjutnya? Terus ikuti ceritanya!
40 parts