Kogasaka You, seorang pemuda jenius yang berusia 15 tahun. Setelah kematian ibunya yang misterius, Ia menutup dirinya untuk mempercayai orang lain. Kemudian dia dipindah untuk bersekolah di Seihan Academy yang dibangun oleh ayah tirinya. Di malam pertamanya tinggal di Seihan Academy, tiba-tiba ada dua orang siswa dan siswi yang mengaku adalah anaknya dari masa depan -Kogasaka Rei dan Kogasaka Rin. Kogasaka Rei yang bisa membuat cela di ruang. dan Kogasaka Rin yang bisa menghentikan waktu. Malam itu pula dia mengetahui jika bukan hanya dia manusia yang memiliki 'kemampuan khusus'. "Kami akan membunuhmu." Kata dua murid tersebut.