Cuando los Omaticaya lograron expulsar de Pandora a las fuerzas de la RDA, comenzó una época de paz. Jake Sully e Íka formaron una familia con sus hijos Neteyam, Kiri, Lo'ak, Tuk y Spider, un joven humano que quedó atrás cuando los demás abandonaron la luna. Pero la felicidad no podía durar para siempre. Las fuerzas de la RDA regresaron y mejor preparadas para colonizar Pandora. Jake, Íka y su gente comienzan una guerra de guerrillas contra ellos pero cuando un enemigo del pasado regresa y pone en peligro la vida de sus hijos, Jake lleva a su familia a los mares y piden refugio con el clan de las islas: los Metkayina. Sin imaginar que ambos hermanos se enamorarian a primera vista del futuro Olo'eyktan, Toawkey, él hijo del jefe del clan. Toawkey es un jóven que sobresale en todo, sus habilidades de caza no tienen rival entre los demás Metkaina, además de ser inteligente y sabio, tiene el respeto de todo el pueblo y el apoyo de su familia. Como un verdadero Olo'eyktan hará cualquier cosa para proteger al clan del arrecife. Mientras se ajustan a su nueva vida y experimentan el sentimiento del amor, su enemigo sigue buscándolos.