Hace mucho tiempo, en una galaxia muy, muy lejana... La Guerra de los Clones ha empezado. La República y los Separatistas se han sumergido en una sangrienta guerra civil por el control de la galaxia. Estos años de sangriento conflicto han forzado al Concejo Jedi a incrementar la actividad de un grupo secreto conocido como "los Jedi Sombra", encargados del trabajo sucio, como el magnicidio, la desestabilización gubernamental, y el apoyo en golpes de estado que favorezcan los intereses de la República, pero principalmente del exterminio masivo de los Sith, su cultura y seguidores. La líder de esta organización, Jaina Lira, ha enviado a uno de sus mejores soldados y padawan del infame Rahm Kota, John Strider, tras el rastro de una Sith acusada de ser esclavista. Tras varios meses de búsqueda e investigación, el rastro de tan maligno ser ha llevado al Sombra a su mundo natal, Felucia, donde espera encontrar y exterminar a esta vil servidora del Lado Oscuro.
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