Nadie sabe cómo ni por qué, pero para cuando se dieron cuenta de lo que estaba pasando, la Tierra y el Mundo Digital ya se habían vuelto uno. Ahora, con la población mundial reducida a menos de un quinto del total, los digimon se han vuelto una amenaza y la humanidad solo puede defenderse. Theo perdió a su madre tan joven que no la recuerda. Criado por un padre que trabaja con la Resistencia, lo único que sabe del mundo exterior a la Cúpula V es que nunca debe ir ahí. Sin embargo, su mundo cambia cuando de casualidad conoce a uno de los digimon que la humanidad tanto resiente, Dorimon. ¿Cómo logró cruzar la barrera?, ¿y por qué no se parece en nada a lo que padre le contó?, pero sobretodo ¿qué es eso de ser un Elegido y qué hará al respecto?