Un chico de 16 años llamado Yuu fue seleccionado para la mejor escuela de magos, aún sin tener magia, pero algo raro sucedió...
Después de desmayarse en la entrada de la escuela se despierta en un salón cuando se escucha un anuncio del director "Monokuma" se ve que hay alrededor de 29 persona en el establecimiento, 22 almunos, 4 profesores y 3 alumnos de otras escuelas.
Aquí fueron llamados para jugar un juego de matanza, alguien asesinara a otra persona y depende del resto descubrí quien es, si aciertan el asesino será ejecutado.
Pero por otro lado si se equivocan... ellos serán los ejecutados.