Em Townsville, uma nova ameaça surge quando seis jóias lendárias, cada uma representando um elemento essencial - Cosmos, Oceano, Terra, Fogo, Ar e Raio - são descobertas. Essas jóias possuem um poder inimaginável e são protegidas por animais místicos e seus guardiões antecessores. As PowerPuff Girls, Blossom, Bubbles e Buttercup, são chamadas para impedir que essas preciosas relíquias caiam nas mãos erradas.
Enquanto as garotas se aventuram para recuperar cada uma das jóias, elas enfrentam desafios inesperados. A ganância desenfreada dos habitantes de Townsville ameaça colocar toda a cidade em risco, com muitos querendo o poder das jóias para si mesmos.Além disso, os Desordeiros reaparecem, mas seu comportamento é enigmático. Ao invés de causar mais caos, eles parecem estar sempre por perto, misteriosamente interagindo com as garotas e as jóias. Suas intenções são incertas, mas uma coisa é clara: eles estão dispostos a fazer de tudo para proteger as PowerPuff Girls, mesmo que isso signifique confrontá-las diretamente.
Em uma corrida contra o tempo, as PowerPuff Girls precisarão utilizar toda a sua inteligência, força e união para superar os obstáculos, desvendar os verdadeiros objetivos dos Desordeiros, derrotar os vilões e proteger as jóias elementares. Será que elas conseguirão salvar o dia mais uma vez e garantir a segurança de Townsville e do mundo?