Después de la intensa batalla en el Valle del Fin, Naruto es llevado al borde de la muerte. Rescatado por Madara y Zetsu, es llevado a la base de Akatsuki, donde le hacen creer que la aldea está feliz con el regreso de Sasuke y no lamenta su pérdida. Profundamente herido por esta traición aparente, Naruto decide unirse a Akatsuki con la firme determinación de cambiar el mundo ninja, incluso si eso significa enfrentarse a aquellos que alguna vez consideró sus amigos.