"La Sombra de Aiko" es una historia de misterio y búsqueda incansable ambientada en la ciudad de Nagoya, Japón. Sigue a Hikari, una joven de 21 años que lleva más de una década intentando resolver el misterio de la desaparición de su madre, Aiko.
Desde que Aiko desapareció cuando Hikari era sólo una niña de 6 años, la vida de Hikari se ha detenido en el tiempo. Obsesionada con encontrar respuestas, trabaja como detective junior en una agencia de investigaciones privadas, dedicando todos sus esfuerzos a este caso personal.
Cuando la agencia recibe una pista sobre un posible avistamiento de Aiko, Hikari se embarca en una nueva misión llena de peligros y secretos. Sin embargo, esta vez tendrá que trabajar acompañada de Kaori, una analista alegre y enérgica que se convertirá en su asistente.
La relación entre la seria y enfocada Hikari y la espontánea Kaori generará tensión y chispas, a la vez que las acercará en su búsqueda por encontrar a Aiko, viva o muerta. A medida que se adentran en el misterio, Hikari tendrá que enfrentar sus propios demonios internos y cuestionarse si está preparada para la verdad que pueda encontrar.