Au cœur des fleurs, c'est l'histoire de personnes qui vont tout faire pour préserver leur héritage. Milo, Maël et Iris sont tous les trois héritiers du patrimoine de Albert, et vont devoir se battre pour atteindre leurs objectifs.
Milo, petit-fils d'Albert, éloigné de lui par la force, veut reprendre son destin en main et soutenir Maël dans la reprise de la boutique de fleurs. Pour cela, il refuse de suivre la voie toute tracée par sa mère et est bien décidé à découvrir pourquoi elle l'a éloigné de son grand-père.
Maël, ancien apprenti d'Albert qui a toujours été à ses côtés, veut prendre la suite de son mentor, mais doit en parallèle subvenir aux besoins de san jeune adelphe Sacha, abandonné par leurs parents violents.
Iris, fille unique d'Albert et mère de Milo, est prête à tout pour assurer un avenir à son fils, et si elle doit pour cela détruire la boutique traditionnelle de son père, elle le fera sans hésiter.
Mais avant tout, cette histoire est celle de Milo et Maël, qui, à force de se battre ensemble pour la boutique, vont se rapprocher et construire un lien plus fort que tout.
Milo, soutenant Maël par-dessus tout entre ses problèmes familiaux et ses troubles psychologiques, est toujours là pour lui, et Maël accompagnant Milo dans sa recherche d'avenir et le soutenant face à ses difficultés avec sa mère. Ensemble, ils vont guérir leurs blessures, grandir, se protéger, et espérer ensemble, créant leur histoire Au cœur des fleurs.