Souta Youchi, yalnızca en parlak zihinlerin kabul edildiği prestijli akademiye adım attığında, hayatının tamamen değişeceğinin farkında değildi. Ancak, bu okulun yalnızca bir eğitim kurumu olmadığını, aynı zamanda acımasız bir sıralama sistemiyle yönetildiğini öğrenmesi uzun sürmedi.
Öğrenciler, aldıkları sınav puanlarına göre derecelendirilir ve bu rütbe, onların akademideki statüsünü belirler. Daha da kötüsü, düşük sıralamalılar dışlanmaya ve zor durumda bırakılmaya mahkûmdur. Ancak bu sistemin gerçek yüzü, yalnızca en zeki ve en güçlülerin yükselebileceği bir düzenin gölgesinde saklıdır.
Souta, kendini belirsiz ve tehlikeli bir oyun içinde bulurken, sıra dışı öğrenci Chiori ile karşılaşır. Umursamaz tavırlarıyla hiçbir şeyden çekinmiyor gibi görünen bu çocuk, akademinin sırları konusunda Souta'nın sandığından çok daha fazla şey biliyor olabilir.
Gerçek zeka, yalnızca derslerde mi test edilir? Yoksa bu okulun asıl sınavı, perde arkasında oynanan güç savaşlarında mı verilir? Souta, mezun olmayı başarabilecek mi, yoksa sistemin kurbanlarından biri mi olacak?