Doce años antes del inicio de la historia, Ging Freecss abandonó a su hijo, Gon, en manos de su tía Mito en Isla Ballena. Gon, quien siempre creyó que sus padres habían muerto, descubre un día gracias al aprendiz de su padre, Kite, que este aún se encuentra con vida y se ha convertido en uno de los mejores cazadores, individuos de élite y acreditados para el rastreo de tesoros secretos, bestias exóticas e, incluso, otros individuos. Motivado por esta revelación, Gon decide dejar su hogar y presentarse al examen de cazador, una serie de desafíos que buscan probar las habilidades, supervivencia y trabajo en equipo de los participantes. Durante el examen, Gon conoce y se hace amigo de tres participantes: Killua Zoldyck, un joven de la misma edad que el protagonista, quien abandonó su anterior vida como miembro de una de las más famosa familia de asesinos; Leorio, quien busca ser cazador para poder pagar sus estudios de medicina; y Kurapika, el último miembro del clan Kurta, que desea convertirse en cazador con el fin de vengar a su familia y recuperar los ojos escarlata que fueron robados de sus cuerpos por un grupo de mercenarios conocidos como Gen'ei Ryodan.
Killua es un chico que proviene de una familia rica pero poco amorosa, ha vivido una vida llena de odio y sin conocer el significado del amor,pero a pesar de eso es un muchacho inteligente,gracioso,le encanta el sarcasmo pero también es muy compulsivo y no sabe como manejar su ira, ha practicado el arte de la caza y suele internarse en los bosques que rodean su mansión para desahogarse atrapando algunas presas
Gon es todo lo contrario, solo vive con su amorosa y comprensiva Tía Mito quien cada día le da amor y consejos para que el sea un gran hombre. Este chico vive en una cabaña en el bosque la cual dejó su padre en manos de Mito, el es un joven amable,amante de los animales, cariñoso y protector y sobre todo con un espíritu fuerte
¿Esto dos polos opuestos llegarían a entenderse?