Dans une morgue japonaise, Ludivine Hishino, médecin légiste empathique de 36 ans, passe ses nuits à disséquer le silence et les secrets des morts. Mais la morgue cache des mystères bien vivants : des présences fantomatiques veillent dans l'ombre.
Hana, une petite fille espiègle morte lors d'un effondrement sur le terrain de la morgue, joue avec Ludivine et son jeune collègue de sécurité Kenta Shimizu, tandis que Kuro, son fidèle chien fantôme, les accompagne. À leurs côtés, Noboru Sakai, ancien médecin légiste décédé d'un AVC, apparaît parfois pour guider Ludivine lorsqu'elle somnole, et Ojii-san, le gardien des années 30, veille sur elle avec un attachement paternel unique.
Quand Davy Moreau, enquêteur français récemment muté au Japon, arrive pour sa première affaire, il ignore tout de l'étrange vie nocturne de la morgue. Entre autopsies, secrets du passé et manifestations paranormales, Ludivine et ses alliés fantomatiques devront percer les mystères qui hantent ces lieux, tout en protégeant ceux qui vivent dans l'ombre des Veilleurs de la Nuit.