La historia transcurre a mediados del siglo XXII, cerca de 90 años después del primer vuelo warp terrestre y unos 100 años antes de la época de James T. Kirk.
La Federación todavía no existe como tal y apenas comienzan los primeros contactos --no todos diplomáticos-- con las razas extrañas del sector cercano. Son los días de los pioneros de la exploración espacial profunda. Es una época de constantes descubrimientos para los exploradores de la Tierra.
Descubrimientos que se incrementarán notablemente con la salida de los astilleros de un prototipo de nave con capacidad de warp 5, increíblemente más veloz que sus antecesoras, y que tomó cerca de 40 años desarrollar.
La nave es el NX-01 y fue bautizada como Enterprise. Su tripulación tendrá más que nunca la misión de explorar nuevos mundos y descubrir nuevas formas de vida y nuevas civilizaciones, en definitiva, viajar temerariamente donde nadie ha llegado antes.
A su paso encontrará nuevos amigos, pero también encontrará muchos peligrosos adversarios, representados por klingons, andorianos --tienen una larga disputa con los vulcanos--, romulanos y los Sulliban, una raza que usa manipulación genética, que estará asociada a un extraño y misterioso villano proveniente del futuro.
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