La rottura del Sortilegio Oscuro fa recuperare la memoria agli abitanti di Storybrooke, i quali pur potendosi riabbracciare felicemente rimangono bloccati in città a causa di un incantesimo sul confine che fa dimenticare la propria identità a chiunque provi a oltrepassarlo. Nel frattempo, un incantesimo evocato da Gold per vendicarsi di Regina spedisce accidentalmente Emma e Mary Margaret in una porzione di Foresta Incantata scampata al Sortilegio grazie a Cora. Lì, le due eroine uniscono le forze con Mulan e la Principessa Aurora per contrastare i piani di Cora e di Capitan Uncino, desideroso di vendicarsi di Gold per la morte di Milah, riuscendo infine a fare ritorno a Storybrooke insieme ai loro nuovi nemici.
Nel tentativo di ritrovare suo figlio Baelfire, Gold crea una pozione per superare il confine senza perdere i ricordi e parte per New York insieme ad Emma e ad Henry, subito dopo che Uncino ha spinto Belle oltre il limite cittadino facendole smarrire la memoria. Nella metropoli scoppia una doppia rivelazione: Neal Cassidy, l'ex fidanzato di Emma, si rivela essere sia Baelfire che il padre biologico di Henry. Quando la squadra fa ritorno a Storybrooke, si ritrova ad affrontare l'alleanza tra Regina e Cora, che culminerà con la drammatica morte di quest'ultima per mano di Mary Margaret.
Ben presto emerge una nuova e pericolosa minaccia rappresentata da Tamara, la fidanzata di Neal, e da Greg Mendell, giunti in città con l'obiettivo di sradicare completamente la magia dal mondo reale. Durante lo scontro con i due fanatici, Neal cade in un portale che lo riporta nella Foresta Incantata ed viene creduto morto da tutti, mentre Greg e Tamara riescono a fuggire in un'altra dimensione prendendo Henry in ostaggio. Per salvare il bambino, gli storici avversari mettere da parte le divergenze: Emma, Mary Margaret, David, Regina, Gold e Uncino salpano a bordo della Jolly Roger verso l'Isola che non c'è, lasciando Belle a protezione di Storybrooke.
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