(Esto toma alrededor del final de Skyward Sword) A dos años que Link derrotara el Heraldo de la Muerte, Link lleva viviendo en las tierras inferiores junto con Zelda, ya poco a poco estaba poblado de humanos, Link sigue aventurándose tanto en Farone como Eldin o Lanayru. Un día como otro, Link y Zelda fueron invitados a una reunión de celebración por parte de la dragona de agua y ahí conocen a una chica cuyo destino esta en peligro. Durante la reunión, Zelda es secuestrada por un hechicero llamado Grigor como señuelo para atraer su principal objetivo, Link con ayuda de la chica cuyo nombre es Yuly, se embarcan en una nueva aventura en la cual varios misterios serán descubiertos a lo largo de este místico y misterioso viaje que los llevara lejos de la tres regiones...porque esta región se sitúa en una nueva dimensión.
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