Y Si...

En esta versión de TMNT los chicos terminan en manos de los Kraangs antes que Hamato Yoshi. Pero por un error los hermanos son separados desde que son bebés ya mutados a distintos lugares del universo. Siendo criados por enemigos conocidos como los Tricerators o los Salamandrianos, cambiando el curso de sus historias. Pero el destino, el odio y rencor entre razas alienígenas hará que sus caminos se crucen de nuevo en la tierra. Todos bajo un mismo enemigo, los Kraangs, quienes comenzaron todo esto y quienes se quedaron con uno de los hermanos para completar su serie de experimentos de armas biológicas.