ZeroUm acontece em uma era fictícia onde após grandes acontecimento o mundo adquire uma geografia singular com um único continente habitável chamado de Terra Nova, dividido em treze distritos onde a corrupção e as gangues dominam. O destino acaba por reunir três jovens vitimas desse corrupto sistema e que com ajuda e suporte daqueles que não se deixaram contaminar se levantam como uma força de resistência. Após entrarem na maior e mais avançada universidade de tecnologia, os três, orientados pelo gestor da universidade criam um sistema de inteligência artificial que dá inicio a um império denominado de Cerberus, e com esses poderosos recursos em mãos entram em conflito com as gangues e os sistemas de corrupção que assolam seu mundo. A historia gira em torno desse confronto, traições são enfrentadas, perdas que os fazem fraquejar e por em teste suas determinações. Eles são obrigados a amadurecer e por forças maiores descobrem da maneira mais difícil que neste mundo paga-se um alto preço por defender seus ideais.