La historias comienza despues de la invasión de Nueva York, donde las tortugas tienen que escapar a la vieja granja en el bosque de April. Ese dia, era cercano al dia que Keyla volveria a la ciudad, perdiendose en la invasión. En el campo, Rapha comienza a escuchar la voz de Keyla en su cabeza, pidiendole ayuda, diciendole que regreso a Nueva York. Las tortugas se reencuentran con Fer, que esta dispuesta a volver a la ciudad en busca de Keyla, y a recuperar la ciudad.