I miss you, Brother.

Der Uchiha Clan plant einen Komplott gegen das Dorf und die Durchsetzung steht kurz bevor die Beiden Ninja die dem dritten Hokage und seinen engsten Vertrauten direkt unterstehen sind Itachi- und Shisui Uchiha. Diese wollen versuchen den Plan ihres Clanes anders zu zerschlagen als wie es die Obersten des Dorfes wollen, nämlich ihn auszulöschen. Shisui schlägt vor mit seinem Mangekyo-Sharingan den gesamten Clan mit einem Gen-Jutsu zu belegen so das Dieser von ihren rebellischen Vorhaben abgehalten wird ohne getötet werden zu müssen. Doch dieser Plan läut schief als Danzo, einer der Obersten von Konohagakure und der Leiter einer Spezialeinheit, Shisui überfällt und ihm eines seiner Augen nimmt, da er eindeutig für die Vernichtung des Clanes ist. Shisui kann mit der Kraft seines Susano'o entkommen und wird dann etwas später von seinen besten Freund Itachi gerettet. Er erklärt ihm das er ohne sein zweites Auge nicht in der Lage ist das Gen-Jutsu zu erschaffen und so trifft er eine schwerwiegende Entscheidung er gibt Itachi sein zweites Auge und die Aufgabe den Clan aufzuhalten und Konoha zu beschützen. Dazu will er ihm die Kraft des Mangekyo-Sharingans geben indem er sich von Itachi umbringen lässt. Kurz vor seinem Tod sagt er das Itachi sich um seinen kleinen neun jährigen Bruder kümmern soll egal wie.

An dem Abend an dem Itachi den Clan auslöscht lässt er genau zwei Personen leben: Seinen eigenen Bruder, Sasuke Uchiha und den Bruder von Shisui, Hakuma Uchiha. Sasuke lässt er in dem Glauben das er den Clan nur aus selbstsüchtigen Zwecken ausgelöscht hat um diesen stärker zu machen und ihm irgendwann die Wahrheit zeigen zu können. Hakuma nimmt er mit sich zu der Organisation Akatsuki. Hier beginnt die Geschichte des kleinen Uchiha.