A pesar de su gran fuerza, Red siempre se caracterizaba por su alegría, siempre estar rodeado por sus amigos y crear un perfecto ambiente. Cuatro años han pasado desde que eso se acabó. Red vivía en la cima del monte Plateado junto a su equipo Pokémon. Muy pocos lograban llegar a la cima, y los que lo hacían, volvían en cuestión de minutos, aterrados y sin ganas de volver. Un equipo de villanos pone en marcha un plan. Destrucción en las regiones Kanto y Johto. Los demás DexHolders deben salvar las regiones, pero no lo lograrían sin Red. ¿Volvería el chico que llevaba cuatro años solo, sin querer ver a nadie más que a sus Pokémon?