Il existe parmi le commun des mortels, des chasseurs de dragons. Les dragons sont des créatures ayant eu un corps terrestres et certains ont élevés ces chasseurs de dragons en leur apprenant la façon de les tuer. Mais un jour, leur déesse, qui été une humaine fut tuée et les dragons se transformèrent en esprits qui sous la colère, s'emparent du corps d'humain pour faire le mal. Les chasseurs de dragons sont regroupés dans des lieux invisibles aux yeux des humains « normaux » appelés guildes que l'on trouve dans le monde entier. Natsu est un jeune chasseur de dragons mais surtout, un des meilleurs. Un jour, il va faire la rencontre d'une jeune blonde du nom de Lucy, à qui il sauva la vie.