FoE - Fallen Invincible

Około 480 lat po ataku Zebr na Equestrię...
Grupa Nemezis, po przeżyciu licznych przygód, zaczyna się rozpadać. Pierwszy odpada główny bohater opowieści, Azure Skylight. Pokonany przez swojego genetycznego brata, Shadow Thundera, trafia w kopyta Instytutu, w SUB2, gdzie spotyka zarówno Arrow Heart i Katharsis, jak i Liselotte, Scalpelsama i paru innych. Tam Azure, który do tej pory walczył z Instytutem, zmuszony jest przejść na ich stronę.
Po niedługim czasie SUB2 przypuszcza atak na FrostWolfa w celu zniszczenia Nemezis i zniewolenia Vert, dziewczyny Skylight'a. W międzyczasie część Nemezis atakuje SUB2, ale szybko zostają rozbici. Po tych wydarzeniach Nemezis rozpadło się...
Ale Instytut nie osiągnął swojego celu. Nadal nie udało im się schwytać Vert, która wraz z Ignite, Hunter Spirit'em i Thunderbolt'em chowają się w jednej ze Stajni, daleko poza wzrokiem Instytutu... Jak im się przynajmniej wydaje.

I to w tym miejscu zaczynamy naszą historię...