Huevo de Pascua #1: Asesinos rechazados: En la Oficina de la Máscara Negra, hay tres archivos de posibles asesinos que fueron rechazados, ellos son: Cheshire, David Cain y Black Spider.
Huevo de Pascua #2: Hombre del Calendario: El Hombre del Calendario hace un cameo durante la primera invasión a la Prisión de Blackgate, también es referenciado en la Pared de Detectives de la Baticueva y su celda es visible en la Prisión de Blackgate.
Huevo de Pascua #4: DC Brands: Hay marcas y ejemplos que hacen referencia al universo DC: AmerTek, Booster Gold International, Blaze Comics, Big Belly Burger, Ferris Aircraft, GothCorp, Janus Cosmetics, Cale-Anderson Pharmaceuticals, Koul-Brau Breweries, Hell's Gate Disposal Services, Riley's Old Irish Pub, Mendo Soap, Soder Cola, y Stacy's.
Huevo de Pascua #6: Año Uno: En las Cintas de Extorsión, el Comisionado Loeb tuvo una conversación con Máscara Negra que hablaba de Arnold Flass, uno de los personajes secundarios de Batman: Año Uno. La paliza que Flass le dio a Gordon, así como su posterior humillación por parte de Gordon en el mismo cómic, también recibió una referencia indirecta en la misma cinta, en la que Loeb desearía poder enviar a uno de sus policías para "hacer entrar en razón a Gordon", sólo para que Black Mask le recordara que intentaron ese acercamiento con Flass y fracasó. La aventura de Gordon con Sarah Essen también se menciona indirectamente en otra cinta, en la que Loeb ordena al entonces corrupto oficial del GCPD Harvey Bullock que se acerque a él y trate de desenterrar cualquier suciedad, y también implica que debe organizar una trampa de miel para Gordon.
Huevo de Pascua #8: Burgess Meredith: Antes de encontrar al Pingüino en la Oferta Final, puedes encontrar un modelo a escala del barco en una vitrina. El diálogo que acompaña al Pingüino revela que la Oferta Final fue originalmente llamada la Olivia B. Meredith - una referencia a Oliver Burgess Meredith, el actor que retrató al Pingüino en el programa de televisión de Batman de 1960.
Huevo de Pascua #15: Penelope Young: El apartamento de Penélope Young se ve en las Torres Lacey, pero está sellado por la oficina debido al asesinato que ocurrió antes.
Huevo de Pascua #16: El mensaje secreto de Enigma: En la sala de servidores, hay números en la pantalla del ordenador que podrían ser un mensaje secreto de Enigma.
Huevo de Pascua #19: Planos del Salón del Iceberg: En la oficina de Penguin, hay un plano del Salón Iceberg.
Huevo de Pascua #20: Campanas de cascabeleo, Batman Smells: En el encuentro final de la Prisión Blackgate, el Guasón canta una parte de la canción "Jingle Bells, Batman Smells". El Guasón de Mark Hamill la canta en su primera aparición en Batman: La Serie de Animación, también es la primera línea que hace en la serie. Antes de interrogar a un prisionero que se escapa de Blackgate, canta cuando se ríe "jajajaja..... Jingle... campanas... jajajaja... Batman... huele... jajajaja".
Huevo de Pascua #21: Legado de Arkham: Hay texturas y accesorios que hacen referencia a la serie de Arkham: CCTV del Asilo Arkham, fotos del Cocodrilo asesino, algunos trucos del Guasón, el sombrero de Pingüino, el equipo de Ratcatcher, Baudelaire, el periódico de los padres de Prometeo abatidos, el retrato de los Cobblepots y el póster de Solomon Grundy.
Huevo de Pascua #22: DC Locations: Hay un cartel con los nombres de las ciudades: Metrópolis, Ciudad Central, Keystone, Ciudad Maravilla y Ciudad Costera.
Huevo de Pascua #23: Chuck Dixon: Los muelles Dixon son una referencia al escritor de la serie de Batman, Chuck Dixon.
Huevo de Pascua #24: Paraguas de pingüino: Se puede oír a los matones del Pingüino hablando de sus paraguas. Uno de los paraguas mencionados tiene espirales y se usa para hipnotizar a la gente, parecido a un paraguas usado en una escena de Batman Returns.
Huevo de Pascua #25: Fotos de la familia: Hay varias fotos familiares en el juego: La familia de Aaron Cash, la familia de Branden, un joven Bruce Wayne con sus padres, y una foto de la primera esposa de Gordon, Barbara Kean Gordon.
Huevo de Pascua #27: Gatúbela y el largo Halloween: En la pizarra que muestra la familia Falcone en la GCPD, en la lista con la hija de Carmine Falcone está escrito "Selina ???". Puedes ver varios arañazos en la pared de su apartamento.
Huevo de Pascua #29: Frío, corazón frío: Se puede escuchar al Guasón en los créditos cantando "Cold, Cold Heart", como la vez que en los créditos de la ciudad de Arkham canta "Only You". Mientras se escuchan los créditos, se puede escuchar a Jack Ryder entrevistando a Quincy Sharp, quien está ansioso por reabrir el Asilo Arkham, diciendo que la fuga [del Guasón] es culpa de la Prisión Blackgate, para luego decir que reabrirá el Asilo Arkham para admitir a los internos anormales.
Huevo de Pascua #30: Escuadrón Suicida: Después de que los créditos terminan, Amanda Waller es vista contactando a Deathstroke en Blackgate, diciéndole que participe de cierto proyecto, el "Suicide Squad", el portapapeles con el proyecto también se ve en el trofeo de personajes de Harleen Quinzel, y, al final de "Batman: Arkham Origins Blackgate", Deadshot y el Tigre de Bronce son reclutados para el proyecto.
Huevo de Pascua #31: Los orígenes del Guasón: Cuando estés en la Baticueva, si te diriges a la Baticomputadora, y te das la vuelta, verás un tablón de anuncios con los villanos que Batman está investigando.
