Lors d'un monde post-apocalyptique, Aiko Ishii et Nate Drakes Kennedy, deux personnes de la police spéciale, devaient sauver une jeune femme traumatisée, Ayaka, qui fut restée en captivité afin que Umbrella l'utilise comme sujet d'expérience par une organisation responsable de la création des armes biologiques qui contamine avec l'aide d'un virus qui métamorphose les innocents en zombies.