Nah, no creo que sea paranoia tomando en cuenta las cosas que metiste en tu fanfic crossover (Como la humanización de Freddy) evidentemente te va a llegar hate de personas que quieren que sigas el canon al tope, claro, una recomendación que te doy es que si conserves algo del Canon, unos ejemplos serían que:
Freddy y Golden Freddy hayan sido víctimas de un intento de homicidio en una pizzería, esto podría salir en uno de los flashbacks
Que Tattletail tenga una madre extremadamente inestable y aterradora cuando se molesta, este tema podría ser tocado cuando Freddy hable con el y la versión humanizada del furby castroso le diga que no debe llegar ni un minuto tarde a la casa, Freddy le pregunta porque y ahí se habla de esto
Que Sans y Papyrus sigan siendo aquel dúo dinámico de hermanos, no se me ocurre una situación donde se muestre esto pero al ver cómo el fanfic avanza podría ver qué tal está la situación de tu historia y sugerir algo.
No sigas el canon al pie de la letra, pero tampoco te alejes de el por kilómetros, no se si me di a entender.
Solo es una sugerencia, haz lo que quieras