Menos de veinticuatro horas después de su muerte, el hermano de Nobuharu Minato lo llamó para decirle que Furuta parecía estar muerta. Temerosos de ser penalizados por asesinato, el grupo envolvió su cuerpo en mantas y lo metió en una bolsa de viaje. Luego pusieron su cuerpo en un tonel de 208 litros y lo llenaron con cemento húmedo. Alrededor de las 8:00 pm, cargaron y finalmente depositaron el tambor en un camión de cemento en Kōtō, Tokio.15
El 23 de enero de 1989, Hiroshi Miyano y Jō Ogura fueron arrestados por la violación en grupo de la mujer de 19 años que habían secuestrado en diciembre. El 29 de marzo, dos agentes de policía fueron a interrogarlos, ya que se había encontrado ropa interior femenina en sus direcciones. Durante el interrogatorio, uno de los oficiales llevó a Miyano a creer que la policía estaba al tanto de un asesinato cometido por él. Pensando que Jō Ogura había confesado los crímenes contra Furuta, Miyano le dijo a la policía dónde encontrar el cuerpo de Furuta. La policía quedó inicialmente perpleja por la confesión, ya que se referían al asesinato de una mujer diferente y su hijo de siete años que ocurrió nueve días antes del secuestro de Furuta. Ese caso sigue sin resolverse hasta el día de hoy.
La policía encontró el tonel que contenía el cuerpo de Furuta al día siguiente. Fue identificada a través de huellas dactilares. El 1 de abril de 1989, Jō Ogura fue arrestado por una agresión sexual por separado y posteriormente arrestado de nuevo por el asesinato de Furuta. A esto le siguió la detención de Watanabe, Minato y el hermano de Minato. Se identificó formalmente a otros cómplices que participaron en el abuso de Furuta, entre los que estaban Tetsuo Nakamura y Koichi Ihara, que fueron acusados de violación después de que se encontrara su ADN en el cuerpo de la víctima y dentro de él