Po oczyszczeniu i energetyzacji kryształy należy zaprogramować, czyli nadać im konkretną intencję. Ponieważ świadomość niektórych kryształów może być uśpiona, należy je również aktywować. Do tego celu musimy najpierw zestroić swoje wibracje z wibracjami kryształu. Medytujemy z nim kilka minut, dotykamy dłońmi, oddychamy powoli w jego kierunku. Następnie, kładziemy go na serce, skupiając nasze myśli na celu, do którego chcemy go użyć. Nadajemy mu intencję mówiąc: „Aktywuję ten kryształ w celu np. pozbycia się toksyn z mojego organizmu". Aby działanie kryształu było jak najbardziej skuteczne i skoncentrowane, programujemy go tylko na jeden konkretny cel. Na końcu nie zapomnijmy podziękować za jego pomoc.
Tak zaprogramowany i aktywowany kryształ powinien być przechowywany w woreczku z naturalnego materiału. Jeżeli przechowujesz swoje kryształy razem, pamiętaj, że nie powinny się dotykać, ponieważ mogą zakłócać swoją energię.
