Profesyonel futbol takımı, Türk futbol tarihinin ilk uluslararası başarısı olan Balkan Kupası'nı (1966-67) kazanmıştır. Kupa Galipleri Kupası'nda (1964) çeyrek final oynamış, 2008 yılında ise UEFA Şampiyonlar Ligi çeyrek finaline kadar yükselmiştir. Ayrıca 2012-2013 sezonunda UEFA Avrupa Ligi'nde yarı finale çıkmıştır. U-15 takımı 2011 yılında Avrupa şampiyonu olmuştur.
Basketbol Erkek Takımı, FIBA Europe Kupası'nda 2005 yılında Dörtlü Final oynamış;Euroleague'de 2007-08 sezonunda çeyrek finale, 2014-15 sezonunda ise Final Four'a ulaşmıştır. Kadın Basketbol Takımı 2004 ve 2005 yıllarında FIBA Kadınlar Euro Cup'ta Dörtlü Final'e ulaşıp, 2005 yılında final oynamıştır. 2006-07 sezonundan itibaren her sene Avrupa'da Şampiyonlar Ligi'nde çeyrek final oynamış; 2011-12 ve 2014-15 sezonlarında Avrupa dördüncüsü olmuş, 2012-13 ve 2013-14 sezonlarında ise iki kez Avrupa ikinciliğine ulaşmıştır.
Voleybol Erkek Takımı, Avrupa Erkekler Top Teams Kupası'nda 2004-05 sezonunda çeyrek final oynamış, 2008-09 Şampiyonlar Ligi'nde gruptan çıkan ilk Türk takımı olmuş, 2009 ve 2013 yıllarında iki kez Balkan Şampiyonluğuna ulaşmıştır. Kadın Voleybol Takımı 2009'daKadınlar CEV Kupası'nda Avrupa üçüncüsü olmuş, 2009-2010 ve 2010-11 sezonlarındaŞampiyonlar Ligi'nde Dörtlü Final'e kalmış, sırasıyla Avrupa ikinciliği ve üçüncülüğü kazanmıştır. Takım, 2010 yılında Katar'da yapılan Dünya Kulüplerarası Voleybol Şampiyonası'nda, Dünya Şampiyonu olmuş ve tarihi bir başarı elde etmiştir. 2011-12 sezonunda ise Fenerbahçe iki sezondur kılpayı kaçırdığı Avrupa Şampiyonluğu unvanına ulaşmıştır. 2012-13 sezonunda bu defa Avrupa şampiyonu unvanıyla davet edildiği Dünya Kulüplerarası Voleybol Şampiyonası'nda bu defa üçüncü olmuştur. Sarı-lacivertliler aynı sezon CEV Kupası'nda final oynayarak ikinciliğe ulaşmışlardır. 29 Mart 2014'te erkeklerde Avrupa Erkekler CEV Challenge Kupası şampiyonu, kadınlardaAvrupa Bayanlar CEV Kupası şampiyonu olmuştur. Böylece voleybol şubesi, aynı gün içinde hem erkeklerde hem kadınlarda Avrupa şampiyonu olarak spor tarihine geçmiştir.
Fenerbahçe Atletizmde takımlar düzeyinde, 12 kez Avrupa Şampiyonu olmuş, bunun haricinde de çeşitli dereceler almıştır. Erkek Atletizm Takımı A takımlar düzeyinde 1993 ve 2009 yıllarında B Grubu, 1999 yılında C Grubu'nda Avrupa şampiyonu olmuş, 1992, 1995 ve 1996 da ise ikinciliğe ulaşmıştır. Genç erkek takımı 2013 ve 2014'te Avrupa şampiyonu, 2010 ve 2011'de ise Avrupa ikincisi olmuştur. Genç erkek kros takımı ise üç yıl üstüste Avrupa şampiyonluğunu (2009, 2010 ve 2011), 2012'de Avrupa üçüncülüğünü, 2013, 2014 ve 2015'te ise Avrupa ikinciliğini kazanmıştır. Kadın Atletizm Takımı 1997 yılında C Grubu'nda, 1998 yılındaysa B Grubu'nda Avrupa ikincisi olmuştur. Genç kadın atletizm takımı 2010, 2012 ve 2014 yıllarında Avrupa şampiyonluğuna, 2011 ve 2013 yıllarında ise Avrupa ikinciliğine ulaşmıştır. Genç kadın kros takımı 2009'da Avrupa üçüncüsü olmuş, 2015 yılında Avrupa şampiyonluğuna ulaşmıştır.
Fenerbahçe Yüzme Takımı da Avrupa'da önemli başarılara ulaşmış ve bu branşta 2004 ve 2005 yıllarında iki kez Avrupa şampiyonu olmuştur.
Fenerbahçe Boks branşı sporcuları, çeşitli kategorilerde Avrupa ve Dünya şampiyonu unvanlarını kazanmışlardır. Takım olarak ise 1999 yılında Ukrayna'nın Lvov kentinde düzenlenen Avrupa Şampiyon Kulüpler Kupası'nda ikinciliğe ulaşmıştır.
Masa tenisinde erkek takımı Avrupa ETTU Kupası'nda 2007-08 sezonunda final oynamıştır. Kadın takımı ise Avrupa ETTU Kupası'nda 2011-12 ve 2012-13 sezonlarında iki kez Avrupa şampiyonu olmuştur. 2013-14 sezonunda ise Şampiyonlar Ligi'nde final oynamış, 2014-15 sezonunda ise Şampiyonlar Ligi'nde şampiyon olan ilk Türk takımı olmuştur.
2010-11 sezonunda 5 ana branşın 5'inde de (Futbol, Basketbol Erkek, Basketbol Kadın, Voleybol Erkek, Voleybol Kadın) şampiyon olmuştur ve Türkiye'de bu başarıyı gösteren ilk ve tek kulüptür. Ayrıca bunun dışında kalan şubelerinden de şampiyonluklar almış ve tarihinin en şaşalı dönemlerinden birini yaşamıştır.
Futbol BaşarılarıDeğiştir
Fenerbahçe Türkiye tarihinde 94 kez ile en çok resmi lig ve kupa şampiyonu olan takım olmuştur. (Dört büyük takımın topladığı lig ve kupa şampiyonluklarını görmek için Türkiye'de Futbol sayfasındaki Kupa Geçmişi bölümüne bakınız.)
Türkiye'deki BaşarılarıDeğiştirSüper Lig:Şampiyon (19): 1959, 1960-61, 1963-64,1964-65, 1967-68, 1969-70, 1973-74, 1974-75, 1977-78, 1982-83, 1984-85, 1988-89,1995-96, 2000-01, 2003-04, 2004-05, 2006-07, 2010-11, 2013-2014İkinci (20): 1959-60, 1961-62, 1966-67,1970-71, 1972-73, 1975-76, 1976-77, 1979-80, 1983-84, 1989-90, 1991-92, 1993-94,1997-98, 2001-02, 2005-06, 2007-08, 2009-10, 2011-12, 2012-13, 2014-15
Daha fazla bilgi için: Fenerbahçe'nin lig tarihi
Türkiye Kupası:Şampiyon (6): 1967-68, 1973-74, 1978-79,1982-83, 2011-12, 2012-13Finalist (9): 1962-63, 1964-65, 1988-89,1995-96, 2000-01, 2004-05, 2005-06, 2008-09, 2009-10Türkiye Süper KupasıŞampiyon (3): 2007, 2009, 2014İkinci (2): 2012, 2013Cumhurbaşkanlığı Kupası:Şampiyon (6): 1968, 1973, 1975, 1984,1985, 1990İkinci (7): 1970, 1974, 1978, 1979, 1983,1989, 1996Başbakanlık Kupası:Şampiyon (8): 1945, 1946, 1950, 1973,1980, 1989, 1993, 1998İkinci (7): 1944, 1971, 1976, 1977, 1992,1994, 1995İstanbul Ligleri:Şampiyon (16):1911-12, 1913-14, 1914-15, 1920-21, 1922-23, 1929-30, 1932-33,1934-35, 1935-36, 1936-37, 1943-44, 1946-47, 1947-48, 1952-53, 1956-57, 1958-59İkinci (18): 1915-16, 1917-18, 1921-22,1925-26, 1926-27, 1928-29, 1930-31, 1933-34, 1937-38, 1938-39, 1939-40, 1940-41,1942-43, 1944-45, 1945-46, 1949-50, 1955-56, 1957-58Millî Küme:Şampiyon (6): 1936-37, 1939-40, 1942-43,1944-45, 1945-46, 1949-50İkinci (2): 1943-44, 1946-47Türkiye Futbol Şampiyonası:Şampiyon (3): 1933, 1935, 1944İkinci (2): 1940, 1947Atatürk Kupası:Şampiyon (2): 1964, 1998Spor Toto Kupası:Şampiyon (1): 1966-67Uluslararası başarılarıDeğiştirUEFA Kupası:Yarı Final (1): 2012-133. Tur(Son 32) (3): 2004-05, 2006-07,2009-10Şampiyon Kulüpler Kupası: