В 1828 году русская армия захватила территорию Карачая , несмотря на объявленный им формально нейтралитет в Кавказской войне. Поводом стали карачаевские набеги и предполагаемое участие карачаевцев в набеге на Кавказскую линию с погромом села Незлобного 9 июня 1828 г.20 октября 1828 года произошло семичасовое Хасаукинское сражение , в ходе которого царским войскам (находились под личным командованием генерала Эммануэля), оснащённым артиллерией, удалось оттеснить войска карачаевцев под командованием князя Ислама
Крымшамхалова, избранного на тот период Олием (Верховным правителем). Численность войск Олия Ислама Крымшамхалова составила около 500 воинов, численность войск генерала Эммануэля - 1653 солдата, при 8 орудиях и 2 кегорновых мортирах, участвовали в бою, и ещё один отряд с 2 орудиями прибыл уже после сражения . В самый разгар боя князь Крымшаухалов был ранен в бедро, и руководство карачаевскими бойцами взял на себя молодой воин Казбек Байрамкулов. Однако силы были не равны, и защитникам крепости пришлось отступить. Потери со стороны царских войск составили 262 убитых и раненых,со стороны горцев потери неизвестны.
Присоединение Карачая к империи считалось очень важным достижением царских генералов. Г. А. Эммануэль сравнивал свою победу с овладением знаменитыми Фермопилами . Однако, окончательно Карачай вошел в состав России в 1834 году .
В 1855 году, чтобы закрепить союз карачаевцев с Россией, генерал
Козловский с отрядом из 3 батальонов за три недели бесплатно (без издержек) проложил первую колёсную дорогу в Карачай по непроходимым горным местам .
Энциклопедический словарь Брокгауза и Ефрона, издававшийся в конце XIX - начале XX веков, описывая этнический состав Баталпашинского отдела, отмечал:"В долине верхней Кубани, выше её лесистого ущелья, т. н. Большом Карачае, живёт уже давно татарское племя карачаевцев, оно уже в 1841 покорилось России и осталось на прежних местах, занимается особенно скотоводством; стада огромны. Здесь отечество кефира. Карачаевцы быстро размножаются и в 1865 заняли необитаемую до того долину Теберды"По переписи 1897 года в Российской империи насчитывалось 26 877 карачаевцев . В конце XIX в.
коневодство и скотоводство оставалось главным занятием карачаевцев
