Thor é a maior fraqueza do Homem de Ferro[5] , pois Thor pode facilmente sobrecarregar seus circuitos estorando a armadura e o matando por dentro. Stark também tem debilidades com armas magnéticas pois em uma tal ocasião ficou totalmente paralisado e foi vencido mais uma vez por Capitão América. Outra fraqueza do Homem de Ferro é que ele é um mero humano sem sua armadura, perdendo facilmente para um soldado desarmado da Shield.
