Enam bulan kemudian, BoBoiBoy kembali untuk menetap dan bersekolah di Pulau Rintis, dan bersatu semula dengan kawan-kawan di samping berkenalan dengan seorang budak lelaki misteri bernama Fang yang memiliki kuasa bayang. Pada mulanya Fang berdingin dengan BoBoiBoy dan kawan-kawan, tetapi lama-kelamaan mereka sedar bahawa Fang adalah sekutu dan juga mendapat kuasa daripada Ochobot dari suatu insiden dengan Adu Du. Juga munculnya sebuah ancaman baru yang lebih kuat bernama Ejo Jo yang sekaum dengan Adu Du dan turut bersaing untuk mencari koko, akhirnya menyebabkan Probe hancur dimusnahkan oleh PETAI, iaitu robot suruhan Ejo Jo. Setelas berhempas - pulas, akhirnya Ejo Jo dapat mencuri tiga jam kuasa kawan BoBoiBoy. Maka, BoBoiBoy menyembunyikan diri di markas kotak Adu Du, lantas Ejo Jo datang dan menyuruh PETAI berlawan dengan BoBoiBoy. Selepas itu, robot PETAI akhirnya dapat ditewaskan dengan Fang yang menggunakan kuasa Naga Bayang menyebabkan dia pengsan kerana lemah selepas mengendalikan Naga Bayang. Akhirnya, Ejo Jo sendiri berlawan dengan BoBoiBoy.
Oops! This image does not follow our content guidelines. To continue publishing, please remove it or upload a different image.
Oops! This image does not follow our content guidelines. To continue publishing, please remove it or upload a different image.
