D6'yi atesleyerek karaderililerin hepsini oldurup tum metro halkini kurtarmis olan Artyom ozel Spartan birligine alinir , gunlerden bir gun Kaan adinda biri gelip Artyom'u yatagindan uyandirir ve bir karaderilinin fuze saldirisindan kurtuldugunu soyler, Kaan karaderilinin insanligin geleceginin anahtari olduguna inanir ve onunla barisilmasini ister, Kaan'i hapse atan Sparta birligi lideri Artyom'a Karaderilinin oldurulmesi gerektigini ve bunu bir tek Artyom'un yapabilecegini soyler ve Artyom ile Anna'yi son kalan karaderiliyi bulup oldurmek uzere yer yuzune gitmelerini soyler ve Artyom ile Anna yola koyulurlar, Anna cok iyi bir keskin nisancidir. Merdivenden cikarken Anna Artyom'a gotume bakabilirsin ama asla sahip olamazsin der (ve 3.hikayede Anna Artyomun karisi olur) Artyom keskin nisanci destegi esliginde rasrasyon ile cevrili olan dunyada karaderiliyi aramaya baslar ve bulur da, son kalan karaderili daha sadece bir bebektir, Artyom karaderiliyi oldurmek yerine ona dokunur ve dokundugu anda Transa gecerek kendi gecmisini hatirlamaya baslar, Artyom kendisinin kucukken yer yuzunde 3 arkadasi ile dolasirken ona mutantlarin saldirdigini ve yetiskin bir karaderilinin artyomu kurtardigini gorur, uyandiginda ise karaderili ile birlikte nazi askerleri tarafindan yakalandigini gorur idam edilme sirasinda Pavel adindaki iyi kalpli gozuken biri tarafindan kurtarilir ve ikili iyi arkadas olurlar Artyom da sonradan yakalanan paveli idamdan kurtarir falan bir birlerini kollarlar iyi dostturlar pavel Artyomu kizil hat istasyonuna goturur ve orada Pavelin cok ust rutbeli bir sovyet (dusmanimiz) oldugu anlasilir ve pavel bizi onca ani yasamamiza ragmen bayiltip tutsak edip bize iskenceler eder ama bir sekilde kacmanin yolunu buluruz gene ve borulardan kacarken sovyet birliginin D6'yi (bize ait olan yeri) ele gecirme planini Artyom cok net bir sekilde dinler ogrenir Kaan i bulmayi basaran Artyom Kaan'inda yardimi ile nazi istasyonuna sizip bebek karaderiliyi ordan kacirir ve onu sahiplenip korumaya baslar ve onu en guvenli metro istasyonu olan polis metro istasyonuna gotururken pavel ile yuzlesmek zorunda kalir, karaderili bebek pavelin zihnini okuyup tum planlarini ogrenerek bu planlari artyomunda gormesini saglar. Oyunun sonunda bebek karaderili uyku halindeki yetiskin karaderilileri bulur ve sovyet ile nazi birligini yok etmek icin onlarin yardimini kullanir, yetiskin karaderililer Artyom'a onla iletisime gecmek icin daha sonra tekrar geleceklerini soyleyip giderler ve biter.
