É o primeiro jogo com maior número de lutadores sem personagens repetidos com variações, seguido por Marvel vs Capcom 2 (57 lutadores).
Motaro, originalmente um centauro, deveria ter sido cortado de MK: Armageddon. Contudo, ele está presente, mas na forma de um Sátiro.
Temos a primeira aparição de Chameleon, Khameleon e Meat depois do MK: Trilogy e Mortal Kombat 4.
Em Mortal Kombat Armageddon, os Fatalities não são executados como nas versões anteriores. Agora o jogador cria uma sequência de golpes que resultam no Fatality. As sequências variam desde socos e chutes fortes até a remoção de órgãos e explosão de partes do corpo. Alguns personagens podem utilizar suas espadas para decapitar ou empalar o oponente (Scorpion, Shang Tsung, Cyrax, Li Mei,Sub-Zero,Mileena e Kenshi).
O novo sistema de fatalities não agradou à maioria dos fãs da série, segundo Ed Boon.
Dos 63 personagens do jogo, somente 17 receberam biografias (que eram visualizadas no site do jogo). O motivo foi, aparentemente, o MK vs DC. Embora as biografias existentes sejam esclarecedoras em relação ao enredo do jogo (em alguns casos, até mesmo sobre jogos anteriores), muitos detalhes ficam um mistério.
As sequências de fatalities são:
Fatality
Deadly Fatality
Killer Fatality
Bloody Fatality
Mortal Fatality
Brutal Fatality
Evil Fatality
Vicious Fatality
Savage Fatality
Extreme Fatality
Ultimate Fatality