Mineły dwa lata, od całego incydentu na Kosmicznej Kolonii ARK. Sonic po stracie swojego rywala, był w załamaniu. Tak naprawdę nie uważał go za jego wroga, uważał go za kogoś na kogo może polegać. Wszyscy którzy byli wcześniej na ARK wrócili na swoją planetę i ponownie wrócili do swojego codziennego życia. Jednakże pewnego dnia, Sonic doświadczył coś co zmieniło jego życie. Jakie nowe problemy czekają na bohatera? Jakie zło czycha na niego i na cały Green Hills? (Jest to taka kontynuacja zdarzeń z Sonic X, ale trochę pozmieniane! Pomysł ofc mój >. <)