Ustadz Abu Bakar Baasyir mendirikan pesantren di Ngukri, Sukoharjo, dengan menebarkan benih-benih Islam Keras. Saat terjadi perpecahan politik karena permasalahan ekonomi di zaman Orde Baru, Ba'asyir memilih tinggal di Malaysia selama 17 tahun. Pilihannya tersebut didasari atas penolakan diberlakukannya asas tunggal Pancasila. Dilansir dari agen intelegen Amerika Serikat, CIA, Ba'asyir membentuk gerakan Islam radikal bersama Jamaah Islamiyah di Malaysia. Gerakan ini masih berkaitan dengan Al-Qaeda.
